两年时间里政府新开发出来的小岛，岛上的一切设施都尚未完善，并且岛上的生态系统也让学者们感到很好奇…………
为了调查这个阿勒斯地区的生态系统，大木博士特意准备好了这几只可爱的宝可梦，想让内木挑选三个年轻人，分别带上木木枭、火稚鸡、圆企鹅的其中一只作为初始宝可梦一同去探查的伙伴，边调查边记录、边修行，帮忙来搞一个生态环境调查的大计划。
内木非常崇拜大木博士，自然不会怀疑他老人家了，自然是同意帮忙了。
不过，问题是找谁帮忙比较好呢？真难选择。
大木博士想了想，又补充说明道：除了这个阿勒斯地区，还有另外两个地区也是如此的这么一个情况。分别是卡罗尔地区和伽洛拉地区。
卡罗尔地区、伽洛拉地区、阿勒斯地区是政府正在建设中的岛屿，这三个岛都不算小，目前，大家都还是对它们一知半解，但亟待了解它们。
除了这个阿勒斯地区，大木博士还分别向前往卡罗尔地区的法桐博士和去了伽洛拉地区的紫杉博士邮寄了宝可梦过去，分别是炎兔儿、叶藤蛇、球球海狮；针粟鼠、火球鼠、小球獭。这些宝可梦全部都是用来给新手训练师当作初始主将宝可梦用的。
为了更好的调查这三个岛屿，大木博士准备好了90个精灵球，他准备为九位即将开始踏上科研之路的少男少女们一个大大的惊喜，一人分得十个精灵球，让他们开开心心地帮助自己去搞科研。
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