诊断家畜传染病的常用方法：临床综合诊断、实验室诊断。
临床综合诊断：临诊诊断、流行病学诊断、病理学诊断。
实验室诊断：组织病理学诊断、微生物学诊断、分子病原学诊断、免疫学诊断。
(二)实验室诊断
1、组织病理学诊断：观察组织学病变，有些疫病引起的病变不明显；有些疫病具有相同的解剖变化，肉眼难作出判断。
2、微生物学诊断：
1病料的采集：采集哪些组织器官，采集方法；
2病料涂片、镜检：抹片，触片，特征形态； （巴氏杆菌，链球菌等)
3分离培养和鉴定：培养基，鸡胚，细胞等分离，再鉴定；
4动物接种试验：选择最敏感的实验动物进行人工感染试验，小鼠，豚鼠，家兔等，剖检观察，分离鉴定。
(口蹄疫能够致死7~9日龄乳鼠，猪水泡病不会)
3、免疫学诊断
1血清学实验：凝集试验、血凝和血凝抑制试验、中和试验、沉淀实验、免疫荧光试验、免疫酶试验ELISA等。
2变态反应：某些动物传染病(慢性传染病)，可对该病病原体或产物的再次进入产生强烈的反应，即变态反应。
变应原(病原体或抽提物)，如结核菌素、鼻疽菌素等。(青霉素试敏)。
4、分子病原学诊断
pcR技术、核酸探针技术、dNA芯片技术等。
诊断结果的判定：
1、在个体水平上判定
1将个体水平的结果与标准或“规范”进行比较；
2与群体结果进行比较，利用诊断的敏感性和特异性计算该结果的阴阳性预测值；
3可以将动物自身急性感染期和恢复期的血清检测结果进行比较，观察是否发生显着变化，转阳(2~4周抗体滴度发生2~4倍的变化)；
4病原的疫苗株与田间流行株免疫应答的差异进行比较。
2、在群体水平上的判定
有临床症状的动物与相同管理条件下无临床症状的动物急性比较分析；
对患病群体和无病群体的检测结果(如特异性抗体应答或滴度水平)进行统计比较，可用来评价病原与疾病的相关性及疾病发生的风险。
(三)样品的采集和运输
1、样品的采集
正确采集和处理样品是检测过程的一个重要环节，决定着诊断的准确性和可靠性，常常被低估。
对外来动物疫病的准确反映和控制措施依赖于妥善的样品采集和保存；
感染早期：应采集病毒复制或排毒部位，呼吸道、鼻咽、粪便、肛拭子。
上皮病变：应采集液体或刮屑。
菌血症和毒血症：应采集血液。
活检或尸检：选择恰当的器官或组织。
采集的样品要具有代表性，做好样品标识。
最佳诊断样品不一定非要取自感染动物，某些情况下环境样品可能更为有效(水、饲料、垫料等圈舍物料)。
样品的保存同样重要，保存方法因样品和检测的目的而异。
1为防止
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